نظام جامع برنامه ریزی در شهرداری مبتنی بر تفکر راهبردی است و برای سه سطح زمانی بلندمدت، میان مدت و کوتاه مدت تدوین شده است.
برنامه بلندمدت شهرداری مشهد مصوبه شماره 3361/2/ش جلسه علنی مورخ 1383/10/21 شورای اسلامی شهر مشهد، برنامه ای بیست ساله با ارکان اصلی بیانیه ماموریت، ارزش ها، بیانیه چشم انداز، اهداف بلند مدت، شاخص های چشم انداز و راهبردها بوده است.
برنامه میان مدت(عملیاتی) برنامه ای چهارساله است که در ادامه به ارکان آن اشاره شده است و زمینه اجرای بلندمدت (راهبردی) را فراهم می آورد. مدیریت تدوین این برنامه برعهده معاونت برنامه ریزی و توسعه سرمایه انسانی شهرداری است.